MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017425	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017425	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017425	AGG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017425	TA	3	6	15179	15184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017425	CTA	2	6	17189	17194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017425	ATA	2	6	17220	17225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017425	TAA	3	9	17271	17279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017425	A	7	7	17278	17284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017425	AGC	2	6	17735	17740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017425	TCC	2	6	18798	18803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017425	TA	3	6	18825	18830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017425	A	6	6	18872	18877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017425	TAT	3	9	18932	18940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017425	T	6	6	18940	18945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017425	TAG	2	6	18957	18962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017425	TGTAG	2	10	19002	19011	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017425	ATCA	2	8	19029	19036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017425	TAA	2	6	19080	19085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017425	T	7	7	19099	19105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017425	TAA	2	6	19143	19148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017425	ATT	2	6	19152	19157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017425	TAG	2	6	19166	19171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017425	AGG	2	6	21619	21624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017425	TAA	2	6	22904	22909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017425	TA	3	6	22915	22920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017425	ATT	2	6	22935	22940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017425	T	6	6	22945	22950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017425	TTTTA	2	10	22974	22983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017425	AAT	2	6	22994	22999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017425	AAAT	2	8	23047	23054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017425	TTA	2	6	23073	23078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017425	TATT	2	8	23111	23118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017425	ATA	2	6	23119	23124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017425	ATATGT	2	12	23165	23176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017425	A	7	7	23183	23189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017425	A	7	7	23202	23208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017425	T	7	7	23268	23274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017425	T	6	6	23281	23286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017425	A	6	6	23289	23294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017425	TA	3	6	23316	23321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017425	TAG	2	6	23338	23343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017425	A	6	6	24691	24696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017425	A	7	7	24699	24705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017425	AGG	2	6	24718	24723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017425	ATTA	2	8	24724	24731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017425	AAGTAA	2	12	25974	25985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017425	AAGA	2	8	26128	26135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017425	AT	3	6	26152	26157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017425	AATTT	2	10	26172	26181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017425	AGT	2	6	26209	26214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017425	GA	3	6	26227	26232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017425	TA	3	6	26298	26303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017425	ATT	2	6	26326	26331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017425	TGT	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017425	ATT	2	6	26393	26398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017425	TTTTG	2	10	26407	26416	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017425	ATA	2	6	26433	26438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017425	CTTTAT	2	12	26439	26450	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017425	ATG	2	6	26451	26456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017425	AAT	2	6	26488	26493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017425	ACA	2	6	27336	27341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017425	TTTA	2	8	28153	28160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017425	TA	3	6	28159	28164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017425	CT	3	6	28165	28170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017425	TAA	2	6	28726	28731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017425	AATA	2	8	28767	28774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017425	TAA	2	6	28797	28802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017425	ATA	2	6	28804	28809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017425	TAA	2	6	28851	28856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.